敦煌種業近年來在省、市委、政府有關部門的大力支持下，堅持為農服務方向，強化創新意識，打造知名品牌，完善利益聯結機制，使公司產品的市場競爭力和農戶帶動能力不斷提高，為推動農業產業化發展做出了突出貢獻。公司于 2003 年被農業部等 9 部委認定為農業產業化國家重點龍頭企業。 2005 年經國家有關單位組織監測審核，確認農業產業化國家重點龍頭企業資格繼續有效。最近，農業部、國家發改委、財政部、商務部、中國人民銀行、國家稅務總局、中國證監會、中華全國供銷合作總社等單位以農經發 [2005]19 號聯合發出《關于表彰全國農業產業化工作先進單位、先進工作者和優秀龍頭企業的決定》，對在農業產業化工作中做出突出成績的 100 個先進單位、 335 名先進工作者和 100 家龍頭企業進行了表彰，并頒發了獎牌和證書，敦煌種業作為我市唯一一家、全省四家、全國百家優秀龍頭企業之一受到了表彰。